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1977年开始招收本科生，1981年开始培养硕士生。2000年获应用数学博士点，实现我校理科博士点零的突破。现有教师83人，其中教授16人（博导9人，校特聘教授1人），副教授28人，具有博士学位的教师57人。拥有数学一级学科硕士点、应用数学博士点、应用数学江苏省重点学科、数学博士后流动站；数学一级学科在教育部学位中心的评估中, 2003、2007年度排名分列全国第25、23位。
近五年来，平均每年主持近10项国家级科研项目和国际合作项目，每年平均有6省部级项目，科研经费每年能达到150万元。5年发表SCI论文463篇，出版教材专著21本，获国家自然科学二等奖两项，江苏省科技进步二等奖、三等奖各一项。招收博士生61名，已有47人获博士学位，有一人获省优秀博士学位论文。此外，数学系还有数位教授获得江苏省"青蓝工程"项目、"333人才培养计划"资助项目，此外还参与工科863、973等国家重点项目。
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数学系下设研究所 |
| 东南大学数学研究所： |
所长：冯克勤教授（兼职教授） |
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常务副所长：陈建龙教授 |
| 东南大学应用数学研究所： |
所长：- |
| 东南大学应用概率统计研究所： |
所长：林金官教授 |
| 东南大学金融统计研究所： |
所长：姚琦伟教授（客座教授） |
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常务副所长：林金官教授 |
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